Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3BQ13214 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3BQ13214 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3BQ13214 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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