Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMD2Q13200 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMD2Q13200 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PSMD2Q13200 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSMD2Q13200 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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