Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXF2Q12947 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXF2Q12947 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXF2Q12947 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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