Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFFO1Q0D2I5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFFO1Q0D2I5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFFO1Q0D2I5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFFO1Q0D2I5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO1Q0D2I5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 323 ms