Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNA1Q09470 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNA1Q09470 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNA1Q09470 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNA1Q09470 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNA1Q09470 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNA1Q09470 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNA1Q09470 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KCNA1Q09470 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNA1Q09470 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNA1Q09470 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA1Q09470 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms