Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE4CQ08493 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4CQ08493 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE4CQ08493 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4CQ08493 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDE4CQ08493 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE4CQ08493 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4CQ08493 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4CQ08493 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4CQ08493 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4CQ08493 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4CQ08493 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4CQ08493 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4CQ08493 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4CQ08493 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE4CQ08493 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4CQ08493 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4CQ08493 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4CQ08493 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4CQ08493 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE4CQ08493 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4CQ08493 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4CQ08493 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4CQ08493 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4CQ08493 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE4CQ08493 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDE4CQ08493 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE4CQ08493 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE4CQ08493 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms