Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLEQ07864 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLEQ07864 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLEQ07864 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLEQ07864 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLEQ07864 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLEQ07864 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLEQ07864 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLEQ07864 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLEQ07864 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLEQ07864 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLEQ07864 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLEQ07864 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLEQ07864 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLEQ07864 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLEQ07864 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLEQ07864 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLEQ07864 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLEQ07864 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLEQ07864 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLEQ07864 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLEQ07864 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLEQ07864 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLEQ07864 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLEQ07864 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLEQ07864 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLEQ07864 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLEQ07864 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLEQ07864 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLEQ07864 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLEQ07864 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLEQ07864 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLEQ07864 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLEQ07864 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLEQ07864 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLEQ07864 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLEQ07864 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLEQ07864 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLEQ07864 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLEQ07864 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLEQ07864 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLEQ07864 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLEQ07864 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLEQ07864 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLEQ07864 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLEQ07864 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLEQ07864 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
POLEQ07864 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
POLEQ07864 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLEQ07864 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLEQ07864 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLEQ07864 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLEQ07864 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLEQ07864 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLEQ07864 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLEQ07864 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLEQ07864 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLEQ07864 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLEQ07864 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLEQ07864 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLEQ07864 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLEQ07864 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLEQ07864 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLEQ07864 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLEQ07864 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLEQ07864 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLEQ07864 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLEQ07864 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLEQ07864 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLEQ07864 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLEQ07864 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLEQ07864 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLEQ07864 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLEQ07864 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLEQ07864 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLEQ07864 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLEQ07864 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLEQ07864 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLEQ07864 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLEQ07864 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLEQ07864 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLEQ07864 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLEQ07864 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLEQ07864 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLEQ07864 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLEQ07864 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLEQ07864 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLEQ07864 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLEQ07864 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLEQ07864 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLEQ07864 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLEQ07864 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLEQ07864 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLEQ07864 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLEQ07864 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLEQ07864 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLEQ07864 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLEQ07864 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLEQ07864 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLEQ07864 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms