Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF9Q07011 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF9Q07011 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF9Q07011 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF9Q07011 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms