Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF90Q03938 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF90Q03938 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF90Q03938 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms