Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPCQ03188 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPCQ03188 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPCQ03188 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CENPCQ03188 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms