Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ID3Q02535 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ID3Q02535 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ID3Q02535 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ID3Q02535 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ID3Q02535 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ID3Q02535 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ID3Q02535 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ID3Q02535 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ID3Q02535 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ID3Q02535 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ID3Q02535 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ID3Q02535 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ID3Q02535 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ID3Q02535 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ID3Q02535 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ID3Q02535 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ID3Q02535 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ID3Q02535 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ID3Q02535 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ID3Q02535 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ID3Q02535 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ID3Q02535 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ID3Q02535 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ID3Q02535 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ID3Q02535 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ID3Q02535 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ID3Q02535 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ID3Q02535 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ID3Q02535 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ID3Q02535 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ID3Q02535 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ID3Q02535 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ID3Q02535 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ID3Q02535 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ID3Q02535 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ID3Q02535 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ID3Q02535 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ID3Q02535 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ID3Q02535 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ID3Q02535 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ID3Q02535 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ID3Q02535 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ID3Q02535 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ID3Q02535 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ID3Q02535 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ID3Q02535 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ID3Q02535 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ID3Q02535 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ID3Q02535 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ID3Q02535 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ID3Q02535 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ID3Q02535 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ID3Q02535 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ID3Q02535 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ID3Q02535 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ID3Q02535 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ID3Q02535 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ID3Q02535 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ID3Q02535 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ID3Q02535 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ID3Q02535 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ID3Q02535 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ID3Q02535 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ID3Q02535 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ID3Q02535 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ID3Q02535 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ID3Q02535 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ID3Q02535 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ID3Q02535 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ID3Q02535 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ID3Q02535 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ID3Q02535 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ID3Q02535 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ID3Q02535 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ID3Q02535 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ID3Q02535 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ID3Q02535 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ID3Q02535 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ID3Q02535 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ID3Q02535 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ID3Q02535 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ID3Q02535 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ID3Q02535 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ID3Q02535 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ID3Q02535 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ID3Q02535 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ID3Q02535 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ID3Q02535 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ID3Q02535 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ID3Q02535 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ID3Q02535 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ID3Q02535 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ID3Q02535 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ID3Q02535 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ID3Q02535 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ID3Q02535 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ID3Q02535 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ID3Q02535 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ID3Q02535 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms