Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK17Q00537 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK17Q00537 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK17Q00537 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK17Q00537 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK17Q00537 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK17Q00537 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK17Q00537 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK17Q00537 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK17Q00537 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK17Q00537 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK17Q00537 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK17Q00537 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK17Q00537 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK17Q00537 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CDK17Q00537 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK17Q00537 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK17Q00537 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK17Q00537 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK17Q00537 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK17Q00537 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK17Q00537 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK17Q00537 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK17Q00537 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms