Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM3AP98173 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM3AP98173 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms