Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA4AP68366 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBA4AP68366 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBA4AP68366 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA4AP68366 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA4AP68366 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms