Protein–RNA interactions for Protein: P62979

RPS27A, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27AP62979 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS27AP62979 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS27AP62979 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS27AP62979 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS27AP62979 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 981.6 ms