Protein–RNA interactions for Protein: P62312

LSM6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM6P62312 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM6P62312 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM6P62312 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM6P62312 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM6P62312 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM6P62312 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM6P62312 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM6P62312 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM6P62312 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM6P62312 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM6P62312 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM6P62312 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM6P62312 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM6P62312 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM6P62312 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM6P62312 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM6P62312 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM6P62312 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM6P62312 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LSM6P62312 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM6P62312 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM6P62312 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM6P62312 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM6P62312 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM6P62312 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM6P62312 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM6P62312 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM6P62312 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM6P62312 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM6P62312 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM6P62312 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM6P62312 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM6P62312 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM6P62312 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM6P62312 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM6P62312 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM6P62312 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM6P62312 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM6P62312 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM6P62312 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM6P62312 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM6P62312 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM6P62312 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM6P62312 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM6P62312 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM6P62312 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM6P62312 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM6P62312 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM6P62312 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM6P62312 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM6P62312 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM6P62312 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM6P62312 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM6P62312 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM6P62312 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM6P62312 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM6P62312 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM6P62312 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM6P62312 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM6P62312 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM6P62312 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM6P62312 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM6P62312 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM6P62312 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM6P62312 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM6P62312 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM6P62312 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM6P62312 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM6P62312 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM6P62312 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM6P62312 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM6P62312 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM6P62312 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM6P62312 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM6P62312 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM6P62312 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM6P62312 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM6P62312 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM6P62312 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM6P62312 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM6P62312 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM6P62312 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM6P62312 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM6P62312 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM6P62312 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM6P62312 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM6P62312 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM6P62312 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM6P62312 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM6P62312 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM6P62312 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM6P62312 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM6P62312 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM6P62312 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM6P62312 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM6P62312 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM6P62312 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM6P62312 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSM6P62312 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSM6P62312 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms