Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN12P56749 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN12P56749 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN12P56749 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms