Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH15P55291 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH15P55291 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH15P55291 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH15P55291 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH15P55291 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH15P55291 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH15P55291 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH15P55291 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH15P55291 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH15P55291 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH15P55291 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH15P55291 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH15P55291 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH15P55291 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH15P55291 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH15P55291 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH15P55291 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH15P55291 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH15P55291 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH15P55291 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH15P55291 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH15P55291 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH15P55291 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH15P55291 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH15P55291 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH15P55291 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH15P55291 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH15P55291 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH15P55291 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH15P55291 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH15P55291 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH15P55291 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH15P55291 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH15P55291 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH15P55291 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH15P55291 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH15P55291 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH15P55291 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH15P55291 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH15P55291 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH15P55291 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH15P55291 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH15P55291 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH15P55291 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH15P55291 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH15P55291 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH15P55291 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH15P55291 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH15P55291 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH15P55291 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH15P55291 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH15P55291 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH15P55291 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH15P55291 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH15P55291 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH15P55291 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH15P55291 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH15P55291 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH15P55291 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH15P55291 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH15P55291 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH15P55291 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH15P55291 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH15P55291 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH15P55291 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH15P55291 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH15P55291 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH15P55291 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH15P55291 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH15P55291 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH15P55291 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH15P55291 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH15P55291 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH15P55291 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH15P55291 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH15P55291 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH15P55291 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH15P55291 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH15P55291 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH15P55291 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH15P55291 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH15P55291 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH15P55291 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH15P55291 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH15P55291 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH15P55291 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH15P55291 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH15P55291 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH15P55291 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH15P55291 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH15P55291 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH15P55291 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH15P55291 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH15P55291 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH15P55291 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH15P55291 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH15P55291 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH15P55291 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH15P55291 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms