Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHA4P54764 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHA4P54764 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHA4P54764 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms