Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2KP53803 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLR2KP53803 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2KP53803 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2KP53803 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2KP53803 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms