Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFIP2P53365 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARFIP2P53365 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFIP2P53365 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFIP2P53365 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFIP2P53365 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms