Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-5P52952 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-5P52952 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NKX2-5P52952 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKX2-5P52952 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms