Protein–RNA interactions for Protein: P52926

HMGA2, High mobility group protein HMGI-C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA2P52926 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGA2P52926 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGA2P52926 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGA2P52926 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGA2P52926 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGA2P52926 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms