Protein–RNA interactions for Protein: P51512

MMP16, Matrix metalloproteinase-16, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP16P51512 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP16P51512 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP16P51512 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP16P51512 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP16P51512 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP16P51512 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP16P51512 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP16P51512 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP16P51512 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP16P51512 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP16P51512 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP16P51512 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP16P51512 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP16P51512 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP16P51512 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP16P51512 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP16P51512 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP16P51512 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP16P51512 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP16P51512 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP16P51512 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP16P51512 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP16P51512 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP16P51512 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP16P51512 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP16P51512 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP16P51512 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP16P51512 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP16P51512 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP16P51512 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP16P51512 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP16P51512 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP16P51512 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP16P51512 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP16P51512 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP16P51512 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP16P51512 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP16P51512 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP16P51512 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP16P51512 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP16P51512 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP16P51512 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP16P51512 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP16P51512 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP16P51512 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP16P51512 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP16P51512 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP16P51512 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP16P51512 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP16P51512 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP16P51512 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP16P51512 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP16P51512 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP16P51512 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP16P51512 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP16P51512 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP16P51512 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP16P51512 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP16P51512 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP16P51512 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP16P51512 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP16P51512 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP16P51512 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP16P51512 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP16P51512 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP16P51512 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP16P51512 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP16P51512 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP16P51512 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP16P51512 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP16P51512 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP16P51512 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP16P51512 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP16P51512 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP16P51512 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP16P51512 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP16P51512 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP16P51512 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP16P51512 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP16P51512 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP16P51512 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP16P51512 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP16P51512 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP16P51512 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP16P51512 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP16P51512 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP16P51512 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP16P51512 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP16P51512 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP16P51512 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP16P51512 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP16P51512 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP16P51512 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP16P51512 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP16P51512 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP16P51512 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP16P51512 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP16P51512 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP16P51512 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP16P51512 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms