Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK7P50613 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK7P50613 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK7P50613 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK7P50613 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK7P50613 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK7P50613 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK7P50613 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK7P50613 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK7P50613 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK7P50613 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK7P50613 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK7P50613 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK7P50613 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK7P50613 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK7P50613 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK7P50613 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK7P50613 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK7P50613 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK7P50613 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK7P50613 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK7P50613 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK7P50613 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK7P50613 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK7P50613 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK7P50613 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK7P50613 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK7P50613 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK7P50613 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK7P50613 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK7P50613 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK7P50613 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK7P50613 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK7P50613 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK7P50613 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK7P50613 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK7P50613 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK7P50613 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK7P50613 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK7P50613 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK7P50613 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK7P50613 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK7P50613 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK7P50613 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK7P50613 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK7P50613 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK7P50613 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK7P50613 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK7P50613 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK7P50613 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK7P50613 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK7P50613 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK7P50613 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK7P50613 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK7P50613 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK7P50613 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK7P50613 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK7P50613 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK7P50613 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK7P50613 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK7P50613 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK7P50613 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK7P50613 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK7P50613 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK7P50613 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK7P50613 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK7P50613 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK7P50613 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK7P50613 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK7P50613 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK7P50613 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK7P50613 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK7P50613 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK7P50613 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK7P50613 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK7P50613 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK7P50613 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK7P50613 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK7P50613 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK7P50613 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK7P50613 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK7P50613 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK7P50613 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK7P50613 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK7P50613 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK7P50613 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK7P50613 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK7P50613 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK7P50613 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK7P50613 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK7P50613 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK7P50613 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK7P50613 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK7P50613 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK7P50613 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK7P50613 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK7P50613 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK7P50613 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK7P50613 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK7P50613 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms