Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX9P48436 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX9P48436 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX9P48436 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SOX9P48436 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX9P48436 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX9P48436 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX9P48436 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX9P48436 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX9P48436 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX9P48436 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX9P48436 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX9P48436 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX9P48436 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX9P48436 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX9P48436 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX9P48436 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX9P48436 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX9P48436 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX9P48436 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX9P48436 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX9P48436 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SOX9P48436 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOX9P48436 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX9P48436 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX9P48436 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX9P48436 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX9P48436 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX9P48436 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX9P48436 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX9P48436 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX9P48436 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX9P48436 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX9P48436 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX9P48436 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX9P48436 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX9P48436 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX9P48436 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX9P48436 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX9P48436 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX9P48436 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX9P48436 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX9P48436 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX9P48436 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX9P48436 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX9P48436 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX9P48436 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX9P48436 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX9P48436 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX9P48436 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX9P48436 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX9P48436 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX9P48436 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX9P48436 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX9P48436 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX9P48436 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SOX9P48436 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SOX9P48436 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SOX9P48436 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SOX9P48436 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SOX9P48436 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SOX9P48436 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX9P48436 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SOX9P48436 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX9P48436 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX9P48436 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SOX9P48436 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX9P48436 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX9P48436 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX9P48436 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX9P48436 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX9P48436 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SOX9P48436 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX9P48436 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX9P48436 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX9P48436 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX9P48436 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX9P48436 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SOX9P48436 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX9P48436 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX9P48436 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SOX9P48436 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX9P48436 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX9P48436 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX9P48436 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX9P48436 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX9P48436 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SOX9P48436 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX9P48436 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX9P48436 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX9P48436 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOX9P48436 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX9P48436 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX9P48436 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX9P48436 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOX9P48436 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX9P48436 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX9P48436 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX9P48436 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOX9P48436 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 559.5 ms