Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL27AP46776 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL27AP46776 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL27AP46776 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL27AP46776 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL27AP46776 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL27AP46776 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL27AP46776 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL27AP46776 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL27AP46776 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL27AP46776 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL27AP46776 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL27AP46776 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL27AP46776 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL27AP46776 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL27AP46776 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms