Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRATP43155 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRATP43155 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRATP43155 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRATP43155 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRATP43155 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRATP43155 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRATP43155 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRATP43155 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRATP43155 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRATP43155 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRATP43155 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRATP43155 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRATP43155 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRATP43155 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRATP43155 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRATP43155 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRATP43155 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRATP43155 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRATP43155 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRATP43155 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CRATP43155 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRATP43155 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRATP43155 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRATP43155 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRATP43155 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CRATP43155 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRATP43155 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRATP43155 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRATP43155 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRATP43155 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRATP43155 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRATP43155 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRATP43155 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRATP43155 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRATP43155 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRATP43155 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRATP43155 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRATP43155 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRATP43155 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRATP43155 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRATP43155 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRATP43155 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRATP43155 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRATP43155 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRATP43155 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRATP43155 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRATP43155 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRATP43155 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRATP43155 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRATP43155 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRATP43155 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRATP43155 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRATP43155 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRATP43155 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRATP43155 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRATP43155 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRATP43155 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRATP43155 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRATP43155 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRATP43155 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRATP43155 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRATP43155 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRATP43155 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CRATP43155 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRATP43155 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRATP43155 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRATP43155 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRATP43155 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRATP43155 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRATP43155 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CRATP43155 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRATP43155 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRATP43155 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRATP43155 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRATP43155 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRATP43155 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRATP43155 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRATP43155 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRATP43155 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRATP43155 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRATP43155 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRATP43155 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRATP43155 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRATP43155 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRATP43155 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRATP43155 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRATP43155 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRATP43155 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRATP43155 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRATP43155 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRATP43155 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRATP43155 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRATP43155 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRATP43155 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRATP43155 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRATP43155 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRATP43155 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRATP43155 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRATP43155 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms