Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MLH1P40692 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH1P40692 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH1P40692 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH1P40692 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH1P40692 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH1P40692 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MLH1P40692 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH1P40692 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MLH1P40692 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH1P40692 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MLH1P40692 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MLH1P40692 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH1P40692 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH1P40692 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MLH1P40692 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH1P40692 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH1P40692 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH1P40692 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH1P40692 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH1P40692 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH1P40692 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH1P40692 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH1P40692 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MLH1P40692 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH1P40692 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH1P40692 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH1P40692 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH1P40692 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH1P40692 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH1P40692 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH1P40692 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH1P40692 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH1P40692 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH1P40692 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH1P40692 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH1P40692 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH1P40692 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH1P40692 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH1P40692 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH1P40692 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH1P40692 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH1P40692 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH1P40692 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH1P40692 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH1P40692 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH1P40692 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH1P40692 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH1P40692 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH1P40692 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH1P40692 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH1P40692 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH1P40692 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH1P40692 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MLH1P40692 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH1P40692 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH1P40692 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH1P40692 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MLH1P40692 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MLH1P40692 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH1P40692 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH1P40692 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH1P40692 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MLH1P40692 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MLH1P40692 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH1P40692 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH1P40692 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH1P40692 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH1P40692 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH1P40692 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH1P40692 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MLH1P40692 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH1P40692 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH1P40692 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH1P40692 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MLH1P40692 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH1P40692 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH1P40692 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH1P40692 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH1P40692 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH1P40692 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH1P40692 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH1P40692 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH1P40692 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MLH1P40692 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH1P40692 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MLH1P40692 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH1P40692 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MLH1P40692 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MLH1P40692 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH1P40692 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MLH1P40692 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH1P40692 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH1P40692 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH1P40692 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MLH1P40692 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH1P40692 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH1P40692 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH1P40692 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH1P40692 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms