Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL4P36578 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL4P36578 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL4P36578 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL4P36578 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL4P36578 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL4P36578 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL4P36578 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL4P36578 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL4P36578 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL4P36578 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL4P36578 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL4P36578 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL4P36578 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL4P36578 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL4P36578 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL4P36578 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL4P36578 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL4P36578 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL4P36578 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL4P36578 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL4P36578 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL4P36578 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL4P36578 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL4P36578 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL4P36578 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL4P36578 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL4P36578 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL4P36578 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL4P36578 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL4P36578 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL4P36578 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL4P36578 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL4P36578 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL4P36578 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL4P36578 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL4P36578 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL4P36578 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL4P36578 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL4P36578 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL4P36578 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL4P36578 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL4P36578 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL4P36578 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL4P36578 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL4P36578 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL4P36578 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL4P36578 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL4P36578 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL4P36578 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL4P36578 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL4P36578 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL4P36578 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL4P36578 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL4P36578 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL4P36578 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL4P36578 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL4P36578 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL4P36578 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL4P36578 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL4P36578 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL4P36578 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL4P36578 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL4P36578 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL4P36578 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL4P36578 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL4P36578 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL4P36578 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL4P36578 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL4P36578 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL4P36578 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL4P36578 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL4P36578 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL4P36578 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL4P36578 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL4P36578 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL4P36578 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL4P36578 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL4P36578 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL4P36578 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL4P36578 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL4P36578 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL4P36578 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL4P36578 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL4P36578 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL4P36578 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL4P36578 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL4P36578 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL4P36578 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL4P36578 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL4P36578 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL4P36578 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL4P36578 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL4P36578 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL4P36578 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL4P36578 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL4P36578 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL4P36578 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL4P36578 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL4P36578 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms