Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BMI1P35226 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BMI1P35226 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BMI1P35226 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BMI1P35226 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BMI1P35226 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BMI1P35226 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BMI1P35226 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BMI1P35226 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BMI1P35226 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BMI1P35226 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BMI1P35226 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BMI1P35226 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BMI1P35226 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BMI1P35226 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BMI1P35226 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BMI1P35226 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BMI1P35226 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BMI1P35226 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BMI1P35226 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BMI1P35226 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BMI1P35226 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BMI1P35226 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BMI1P35226 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BMI1P35226 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BMI1P35226 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BMI1P35226 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BMI1P35226 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BMI1P35226 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BMI1P35226 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BMI1P35226 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BMI1P35226 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BMI1P35226 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BMI1P35226 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BMI1P35226 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
BMI1P35226 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BMI1P35226 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BMI1P35226 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BMI1P35226 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BMI1P35226 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BMI1P35226 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BMI1P35226 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BMI1P35226 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BMI1P35226 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BMI1P35226 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BMI1P35226 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
BMI1P35226 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BMI1P35226 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BMI1P35226 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BMI1P35226 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BMI1P35226 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BMI1P35226 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BMI1P35226 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BMI1P35226 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BMI1P35226 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BMI1P35226 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BMI1P35226 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BMI1P35226 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BMI1P35226 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BMI1P35226 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BMI1P35226 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BMI1P35226 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BMI1P35226 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BMI1P35226 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BMI1P35226 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BMI1P35226 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BMI1P35226 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BMI1P35226 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BMI1P35226 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BMI1P35226 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BMI1P35226 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BMI1P35226 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BMI1P35226 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BMI1P35226 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BMI1P35226 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BMI1P35226 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BMI1P35226 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BMI1P35226 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BMI1P35226 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BMI1P35226 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BMI1P35226 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BMI1P35226 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BMI1P35226 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BMI1P35226 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BMI1P35226 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BMI1P35226 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BMI1P35226 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BMI1P35226 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BMI1P35226 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BMI1P35226 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BMI1P35226 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BMI1P35226 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BMI1P35226 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BMI1P35226 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BMI1P35226 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BMI1P35226 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BMI1P35226 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BMI1P35226 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BMI1P35226 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BMI1P35226 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms