Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR2AP28223 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR2AP28223 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTR2AP28223 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTR2AP28223 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTR2AP28223 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTR2AP28223 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms