Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MARK3P27448 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MARK3P27448 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MARK3P27448 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MARK3P27448 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MARK3P27448 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MARK3P27448 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MARK3P27448 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MARK3P27448 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MARK3P27448 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MARK3P27448 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MARK3P27448 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MARK3P27448 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MARK3P27448 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MARK3P27448 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARK3P27448 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARK3P27448 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARK3P27448 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARK3P27448 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARK3P27448 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARK3P27448 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARK3P27448 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARK3P27448 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARK3P27448 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARK3P27448 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARK3P27448 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARK3P27448 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MARK3P27448 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MARK3P27448 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MARK3P27448 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MARK3P27448 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MARK3P27448 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MARK3P27448 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MARK3P27448 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MARK3P27448 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MARK3P27448 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MARK3P27448 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MARK3P27448 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MARK3P27448 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MARK3P27448 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MARK3P27448 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MARK3P27448 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MARK3P27448 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MARK3P27448 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MARK3P27448 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MARK3P27448 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARK3P27448 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARK3P27448 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MARK3P27448 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MARK3P27448 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MARK3P27448 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MARK3P27448 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MARK3P27448 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARK3P27448 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARK3P27448 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARK3P27448 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARK3P27448 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARK3P27448 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARK3P27448 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARK3P27448 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARK3P27448 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARK3P27448 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARK3P27448 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARK3P27448 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARK3P27448 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARK3P27448 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARK3P27448 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MARK3P27448 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MARK3P27448 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MARK3P27448 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MARK3P27448 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MARK3P27448 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MARK3P27448 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARK3P27448 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARK3P27448 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARK3P27448 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARK3P27448 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARK3P27448 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MARK3P27448 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MARK3P27448 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MARK3P27448 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MARK3P27448 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MARK3P27448 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MARK3P27448 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MARK3P27448 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MARK3P27448 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARK3P27448 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARK3P27448 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARK3P27448 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARK3P27448 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARK3P27448 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MARK3P27448 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MARK3P27448 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MARK3P27448 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MARK3P27448 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MARK3P27448 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARK3P27448 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARK3P27448 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARK3P27448 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARK3P27448 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms