Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1B2P21281 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP6V1B2P21281 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP6V1B2P21281 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP6V1B2P21281 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1B2P21281 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms