Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL2P19875 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL2P19875 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL2P19875 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL2P19875 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL2P19875 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL2P19875 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL2P19875 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL2P19875 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL2P19875 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL2P19875 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL2P19875 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL2P19875 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL2P19875 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL2P19875 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL2P19875 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL2P19875 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL2P19875 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL2P19875 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL2P19875 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL2P19875 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL2P19875 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CXCL2P19875 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CXCL2P19875 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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