Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCLP19338 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCLP19338 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCLP19338 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCLP19338 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCLP19338 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NCLP19338 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NCLP19338 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCLP19338 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NCLP19338 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCLP19338 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCLP19338 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCLP19338 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NCLP19338 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NCLP19338 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NCLP19338 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NCLP19338 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NCLP19338 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCLP19338 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCLP19338 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NCLP19338 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCLP19338 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCLP19338 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCLP19338 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCLP19338 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCLP19338 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCLP19338 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NCLP19338 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NCLP19338 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NCLP19338 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NCLP19338 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCLP19338 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCLP19338 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCLP19338 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCLP19338 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NCLP19338 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NCLP19338 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NCLP19338 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCLP19338 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCLP19338 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCLP19338 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCLP19338 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCLP19338 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCLP19338 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCLP19338 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCLP19338 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCLP19338 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NCLP19338 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCLP19338 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NCLP19338 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCLP19338 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCLP19338 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCLP19338 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCLP19338 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCLP19338 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NCLP19338 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCLP19338 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCLP19338 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCLP19338 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCLP19338 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCLP19338 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCLP19338 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCLP19338 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCLP19338 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCLP19338 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCLP19338 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCLP19338 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCLP19338 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCLP19338 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCLP19338 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCLP19338 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCLP19338 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCLP19338 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCLP19338 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCLP19338 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCLP19338 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCLP19338 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCLP19338 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCLP19338 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCLP19338 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCLP19338 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCLP19338 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCLP19338 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NCLP19338 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCLP19338 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCLP19338 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCLP19338 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCLP19338 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCLP19338 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCLP19338 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCLP19338 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCLP19338 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCLP19338 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCLP19338 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NCLP19338 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NCLP19338 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCLP19338 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCLP19338 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCLP19338 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCLP19338 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms