Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCK1P16333 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCK1P16333 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCK1P16333 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCK1P16333 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCK1P16333 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCK1P16333 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCK1P16333 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCK1P16333 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCK1P16333 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCK1P16333 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCK1P16333 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCK1P16333 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCK1P16333 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCK1P16333 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCK1P16333 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCK1P16333 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCK1P16333 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCK1P16333 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCK1P16333 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCK1P16333 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCK1P16333 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCK1P16333 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCK1P16333 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCK1P16333 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCK1P16333 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCK1P16333 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK1P16333 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK1P16333 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK1P16333 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK1P16333 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK1P16333 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK1P16333 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK1P16333 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK1P16333 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK1P16333 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK1P16333 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK1P16333 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK1P16333 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK1P16333 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK1P16333 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCK1P16333 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCK1P16333 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCK1P16333 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCK1P16333 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK1P16333 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK1P16333 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK1P16333 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK1P16333 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK1P16333 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK1P16333 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCK1P16333 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCK1P16333 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCK1P16333 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCK1P16333 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCK1P16333 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCK1P16333 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCK1P16333 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCK1P16333 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCK1P16333 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCK1P16333 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCK1P16333 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCK1P16333 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCK1P16333 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCK1P16333 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCK1P16333 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCK1P16333 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCK1P16333 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCK1P16333 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCK1P16333 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCK1P16333 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCK1P16333 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCK1P16333 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCK1P16333 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCK1P16333 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCK1P16333 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCK1P16333 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCK1P16333 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCK1P16333 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCK1P16333 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCK1P16333 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCK1P16333 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCK1P16333 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCK1P16333 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCK1P16333 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCK1P16333 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCK1P16333 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCK1P16333 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCK1P16333 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCK1P16333 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCK1P16333 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCK1P16333 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCK1P16333 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCK1P16333 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCK1P16333 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCK1P16333 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCK1P16333 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCK1P16333 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCK1P16333 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCK1P16333 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms