Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM1P13164 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM1P13164 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFITM1P13164 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms