Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COX4I1P13073 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COX4I1P13073 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COX4I1P13073 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COX4I1P13073 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms