Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP1P11387 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP1P11387 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP1P11387 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP1P11387 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP1P11387 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP1P11387 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP1P11387 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP1P11387 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP1P11387 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP1P11387 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP1P11387 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP1P11387 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP1P11387 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP1P11387 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP1P11387 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP1P11387 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP1P11387 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP1P11387 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP1P11387 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP1P11387 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP1P11387 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP1P11387 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP1P11387 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP1P11387 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP1P11387 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP1P11387 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP1P11387 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP1P11387 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP1P11387 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP1P11387 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP1P11387 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP1P11387 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP1P11387 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP1P11387 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP1P11387 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP1P11387 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TOP1P11387 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOP1P11387 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOP1P11387 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP1P11387 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP1P11387 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP1P11387 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOP1P11387 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP1P11387 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP1P11387 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP1P11387 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP1P11387 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP1P11387 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP1P11387 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP1P11387 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOP1P11387 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP1P11387 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP1P11387 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOP1P11387 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP1P11387 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TOP1P11387 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP1P11387 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP1P11387 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP1P11387 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP1P11387 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP1P11387 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP1P11387 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP1P11387 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP1P11387 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP1P11387 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TOP1P11387 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP1P11387 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP1P11387 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP1P11387 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP1P11387 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOP1P11387 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOP1P11387 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TOP1P11387 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOP1P11387 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOP1P11387 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP1P11387 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP1P11387 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP1P11387 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP1P11387 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP1P11387 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP1P11387 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP1P11387 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP1P11387 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP1P11387 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP1P11387 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TOP1P11387 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP1P11387 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP1P11387 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP1P11387 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP1P11387 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP1P11387 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP1P11387 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP1P11387 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP1P11387 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP1P11387 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP1P11387 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP1P11387 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP1P11387 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP1P11387 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms