Protein–RNA interactions for Protein: P10915

HAPLN1, Hyaluronan and proteoglycan link protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN1P10915 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HAPLN1P10915 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN1P10915 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HAPLN1P10915 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HAPLN1P10915 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HAPLN1P10915 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HAPLN1P10915 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HAPLN1P10915 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HAPLN1P10915 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HAPLN1P10915 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HAPLN1P10915 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HAPLN1P10915 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HAPLN1P10915 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HAPLN1P10915 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HAPLN1P10915 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HAPLN1P10915 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HAPLN1P10915 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HAPLN1P10915 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms