Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN1MW3P0DN78 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OPN1MW3P0DN78 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OPN1MW3P0DN78 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OPN1MW3P0DN78 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms