Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM200BP0CF97 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM200BP0CF97 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FAM200BP0CF97 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms