Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3P1P0C860 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3P1P0C860 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3P1P0C860 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3P1P0C860 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MSL3P1P0C860 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSL3P1P0C860 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSL3P1P0C860 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSL3P1P0C860 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3P1P0C860 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MSL3P1P0C860 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSL3P1P0C860 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms