Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRPRAP08240 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRPRAP08240 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRPRAP08240 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRPRAP08240 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRPRAP08240 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRPRAP08240 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRPRAP08240 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRPRAP08240 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRPRAP08240 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRAP08240 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRAP08240 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms