Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYNP07948 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYNP07948 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYNP07948 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYNP07948 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYNP07948 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYNP07948 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYNP07948 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYNP07948 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYNP07948 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYNP07948 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYNP07948 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYNP07948 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYNP07948 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYNP07948 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYNP07948 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYNP07948 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYNP07948 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYNP07948 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYNP07948 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYNP07948 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYNP07948 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYNP07948 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYNP07948 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYNP07948 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYNP07948 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYNP07948 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LYNP07948 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LYNP07948 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LYNP07948 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYNP07948 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYNP07948 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYNP07948 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYNP07948 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYNP07948 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYNP07948 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYNP07948 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYNP07948 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYNP07948 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYNP07948 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYNP07948 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYNP07948 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYNP07948 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LYNP07948 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYNP07948 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYNP07948 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYNP07948 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYNP07948 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LYNP07948 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYNP07948 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYNP07948 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYNP07948 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYNP07948 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYNP07948 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYNP07948 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYNP07948 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYNP07948 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYNP07948 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYNP07948 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYNP07948 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYNP07948 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYNP07948 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYNP07948 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYNP07948 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYNP07948 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYNP07948 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYNP07948 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYNP07948 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYNP07948 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LYNP07948 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYNP07948 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYNP07948 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYNP07948 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYNP07948 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LYNP07948 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYNP07948 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYNP07948 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYNP07948 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYNP07948 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYNP07948 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYNP07948 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYNP07948 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYNP07948 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYNP07948 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYNP07948 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYNP07948 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYNP07948 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYNP07948 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYNP07948 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYNP07948 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYNP07948 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYNP07948 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYNP07948 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYNP07948 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYNP07948 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYNP07948 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYNP07948 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LYNP07948 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LYNP07948 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYNP07948 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms