Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CENPBP07199 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CENPBP07199 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CENPBP07199 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CENPBP07199 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CENPBP07199 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CENPBP07199 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CENPBP07199 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CENPBP07199 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CENPBP07199 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CENPBP07199 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CENPBP07199 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CENPBP07199 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CENPBP07199 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CENPBP07199 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CENPBP07199 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CENPBP07199 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CENPBP07199 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CENPBP07199 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CENPBP07199 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CENPBP07199 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CENPBP07199 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CENPBP07199 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CENPBP07199 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CENPBP07199 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CENPBP07199 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CENPBP07199 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CENPBP07199 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CENPBP07199 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CENPBP07199 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CENPBP07199 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CENPBP07199 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CENPBP07199 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CENPBP07199 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CENPBP07199 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CENPBP07199 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CENPBP07199 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CENPBP07199 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CENPBP07199 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CENPBP07199 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CENPBP07199 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CENPBP07199 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CENPBP07199 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CENPBP07199 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CENPBP07199 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CENPBP07199 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CENPBP07199 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CENPBP07199 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CENPBP07199 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CENPBP07199 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CENPBP07199 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CENPBP07199 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CENPBP07199 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CENPBP07199 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CENPBP07199 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CENPBP07199 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CENPBP07199 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CENPBP07199 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CENPBP07199 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CENPBP07199 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CENPBP07199 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CENPBP07199 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CENPBP07199 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CENPBP07199 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CENPBP07199 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CENPBP07199 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CENPBP07199 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CENPBP07199 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CENPBP07199 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CENPBP07199 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CENPBP07199 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CENPBP07199 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CENPBP07199 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CENPBP07199 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CENPBP07199 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CENPBP07199 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CENPBP07199 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CENPBP07199 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CENPBP07199 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CENPBP07199 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CENPBP07199 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CENPBP07199 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CENPBP07199 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CENPBP07199 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CENPBP07199 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CENPBP07199 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CENPBP07199 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CENPBP07199 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CENPBP07199 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CENPBP07199 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CENPBP07199 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CENPBP07199 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CENPBP07199 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CENPBP07199 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CENPBP07199 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CENPBP07199 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CENPBP07199 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CENPBP07199 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CENPBP07199 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CENPBP07199 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms