Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP1A1P05023 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A1P05023 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP1A1P05023 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP1A1P05023 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms