Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THY1P04216 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THY1P04216 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THY1P04216 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THY1P04216 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THY1P04216 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THY1P04216 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THY1P04216 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THY1P04216 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THY1P04216 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THY1P04216 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THY1P04216 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THY1P04216 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THY1P04216 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THY1P04216 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THY1P04216 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THY1P04216 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THY1P04216 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THY1P04216 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THY1P04216 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THY1P04216 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THY1P04216 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THY1P04216 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THY1P04216 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THY1P04216 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THY1P04216 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THY1P04216 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THY1P04216 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THY1P04216 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THY1P04216 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THY1P04216 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
THY1P04216 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THY1P04216 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THY1P04216 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THY1P04216 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THY1P04216 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THY1P04216 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THY1P04216 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THY1P04216 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THY1P04216 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THY1P04216 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THY1P04216 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THY1P04216 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THY1P04216 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THY1P04216 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THY1P04216 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THY1P04216 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THY1P04216 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THY1P04216 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THY1P04216 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THY1P04216 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THY1P04216 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
THY1P04216 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
THY1P04216 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THY1P04216 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
THY1P04216 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THY1P04216 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THY1P04216 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THY1P04216 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THY1P04216 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THY1P04216 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THY1P04216 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
THY1P04216 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THY1P04216 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THY1P04216 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THY1P04216 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THY1P04216 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THY1P04216 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THY1P04216 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THY1P04216 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THY1P04216 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THY1P04216 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THY1P04216 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THY1P04216 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THY1P04216 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THY1P04216 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THY1P04216 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THY1P04216 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THY1P04216 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THY1P04216 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THY1P04216 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
THY1P04216 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THY1P04216 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THY1P04216 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THY1P04216 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THY1P04216 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THY1P04216 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
THY1P04216 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THY1P04216 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THY1P04216 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THY1P04216 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THY1P04216 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THY1P04216 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THY1P04216 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THY1P04216 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THY1P04216 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THY1P04216 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THY1P04216 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THY1P04216 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THY1P04216 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms