Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TK1P04183 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TK1P04183 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TK1P04183 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TK1P04183 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TK1P04183 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TK1P04183 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TK1P04183 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TK1P04183 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TK1P04183 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TK1P04183 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TK1P04183 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TK1P04183 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TK1P04183 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TK1P04183 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TK1P04183 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TK1P04183 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TK1P04183 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TK1P04183 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TK1P04183 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TK1P04183 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TK1P04183 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TK1P04183 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TK1P04183 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TK1P04183 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TK1P04183 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TK1P04183 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TK1P04183 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TK1P04183 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TK1P04183 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TK1P04183 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TK1P04183 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TK1P04183 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TK1P04183 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TK1P04183 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TK1P04183 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TK1P04183 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TK1P04183 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TK1P04183 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TK1P04183 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TK1P04183 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TK1P04183 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TK1P04183 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TK1P04183 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TK1P04183 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TK1P04183 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TK1P04183 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TK1P04183 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TK1P04183 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TK1P04183 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TK1P04183 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TK1P04183 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TK1P04183 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TK1P04183 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TK1P04183 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TK1P04183 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TK1P04183 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TK1P04183 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TK1P04183 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TK1P04183 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TK1P04183 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TK1P04183 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TK1P04183 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TK1P04183 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TK1P04183 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TK1P04183 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TK1P04183 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TK1P04183 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TK1P04183 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TK1P04183 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TK1P04183 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TK1P04183 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TK1P04183 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TK1P04183 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TK1P04183 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TK1P04183 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TK1P04183 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TK1P04183 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TK1P04183 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TK1P04183 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TK1P04183 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TK1P04183 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TK1P04183 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TK1P04183 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TK1P04183 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TK1P04183 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TK1P04183 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TK1P04183 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TK1P04183 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TK1P04183 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TK1P04183 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TK1P04183 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TK1P04183 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TK1P04183 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TK1P04183 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TK1P04183 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TK1P04183 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TK1P04183 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TK1P04183 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TK1P04183 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms